消糜栓和甲硝唑栓在多个方面存在明显的区别。

首先，它们的成分不同。消糜栓的主要成分包括人参茎叶皂苷、紫草、黄柏等中药成分，而甲硝唑栓则主要含有甲硝唑这一抗生素成分。

其次，它们的功效和治疗的疾病也不同。消糜栓主要用于治疗湿热带下、宫颈柱状上皮异位等，其功效包括清热解毒、燥湿杀虫以及去腐生肌、止痒消炎等。而甲硝唑栓则主要用于治疗滴虫性阴道炎、细菌性阴道炎等，具有抗厌氧菌和消炎杀菌的作用。

此外，消糜栓属于中成药，是多种中药经过加工制作而成，其副作用相对较小，但也可能导致外阴红肿瘙痒、灼烧感等。而甲硝唑栓作为抗生素药物，其副作用可能包括胃肠道不适、过敏反应等，但它在消炎杀菌方面具有较强的作用。

需要注意的是，无论是消糜栓还是甲硝唑栓，都应在医生的指导下使用，避免擅自用药或长期无节制地使用。同时，用药期间应注意个人卫生，保持外阴清洁，如有任何不适症状或异常反应，应及时停药并就医。

总的来说，消糜栓和甲硝唑栓在成分、功效、治疗的疾病以及药物类型等方面都存在明显的区别，选择哪种药物应根据具体的病情和医生的建议来决定。