乙肝病毒感染自然史分为5个阶段：

1、免疫耐受期。

也就是我们常见的大三阳，肝功能正常。这个阶段多见于青春期以前，也属于健康携带阶段。

2、HBeAg阳性免疫激活阶段。

临床上常见的大三阳，ALT反复异常。

3、非活动性HBV携带阶段。

多见于小三阳，肝功能正常，病毒低水平复制。这时人体免疫力相对较好，自我控制住了病毒。病人可长期处于这种稳定状态至终身。(注意：不是小三阳就一定病情不活动，不活动的小三阳一般表面抗原滴度较低)

4、HBeAg阴性慢乙肝阶段。

小三阳，或1、5阳，但肝功能再次反复异常。

5、HBsAg阴性阶段。

多见于2、4、5阳性阶段，肝功能稳定。HBVDNA阴性。

注意：除免疫耐受期外以上各阶段均可发生肝硬化，或发生肝癌，只是各阶段发生率不同。