钩端螺旋体病的临床症状是极复杂多样的，轻型病例可以无明显症状，严重的则甚至可以引起死亡。不同菌型和同一菌型的不同毒力株，以及由于受感染者的个体差别和免疫力的差异等因素，都能影响临床表现。另一方面钩端螺旋体侵犯不同的脏器，所以，其临床症状实为在流行性感染性疾病基本表现的基础上，加上脏器受损的症状如肝炎、肾炎、脑膜炎、肺炎、出血等。

1.潜伏期本病的潜伏期多为5～10天。潜伏期最短1天，最长有达35天者。

2.临床表现多数病例为突发4～7日自限性无黄疸病，特征为发热骤起、头痛、肌痛、发冷、咳嗽、胸痛、颈硬等。约10%病例出现黄疸、出血、肾衰竭及神经功能失常。体征有发热38℃～40℃、结膜溢血、肝肿大、脾肿大、弥漫性腹部压痛、肌肉压痛、脑膜病征(12%～40%)以及躯干斑性、荨麻诊性或紫癜性皮疹)等。

钩端螺旋体病的临床症状可极悬殊，轻者可无任何自觉症状或仅有类似上呼吸道感染的症状，重者可出现肝、肾功能衰竭、肺大出血甚至死亡。