舌咽神经痛的确诊并非通过各种仪器检查，而是通过给病人查体。主要是要到医院看医生，让医生来明确你得是不是舌咽神经痛。根据疼痛的特点，持续的时间，疼痛的剧烈程度和分布的区域来判断，比如说短暂性的、闪电样的、刀割样的感觉，或者烧灼感，这样的一个特点，那根据它的分布区域，可以诊断为是舌咽神经痛。做辅助检查，通常包括做脑部CT、核磁等，反而都是正常的。另外一种方法，是将地卡因喷洒到咽部，如疼痛缓解，对本病确诊则有意义。据统计，地卡因试验的正确率为89.6%。结果阴性者，如临床症状典型，不能除外本病的诊断。