据统计，不孕症治疗怀孕的妇女，自然流产发生率高达24%-28%。这是因为这些妇女往往存在子宫的疾病，以及卵巢的内分泌功能不全。子宫是胚胎着床、生长发育的场所，而胚胎的早期发育又离不开卵巢妊娠黄体与孕激素的支持，如果这两个环节出现故障，或存在免疫性不孕的因素，就会发生怀孕后流产的可能。

例如：纵隔子宫切开术后、双角子宫矫治术后、子宫肌瘤剥除、宫腔粘连分离术后、子宫内膜炎治疗后，均可因为子宫解剖形态的改变或宫腔内膜不同程度的病变，使子宫腔与内膜不能满足胎盘生长发育的需要，以致胚胎枯萎死亡而流产。又如卵巢内分泌紊乱，排卵有障碍，多囊卵巢，子宫内膜异位症经治疗后怀孕的妇女，仍可因为卵巢的黄体功能不足，得不到足量的孕激素作用，胎盘功能减退而致流产。还有一些不孕症治疗怀孕后，如发生母子血型不合，也可发生流产。