甲亢的治疗除了常规药物治疗外，还包括手术切除和131碘治疗(喝碘水)，但是和药物治疗一样，这些方法也存在副作用，最常见的为永久性甲状腺功能减退(这与甲亢正好相反，为甲状腺切除或破坏过多所致)，一般需要终生服用相关药物，另外有部分甲亢突眼的患者在进行131碘治疗后突眼的情况出现明显加重。

因此这些治疗需要由有经验的专科医师操作，并且在治疗前需要充分与医师沟通，了解可能存在的副作用后再决定是否进行。并注意定期复查甲状腺功能等。