检测幽门螺杆菌感染主要包括侵入性检查与非侵入性检查。
侵入性检查是指通过胃镜活检胃黏膜组织作检查，常用的有：(1)快速尿素酶试验。这是目前临床上应用最广而又最为便捷的一种检测幽门螺杆菌的方法。具体步骤：将钳取的胃黏膜感染处活组织放入含有尿素和PH指示剂的试验液中，如有幽门螺杆菌感染，由于其含有丰富的尿素酶(此为幽门螺杆菌的重要特性)，将尿素分解成氨和二氧化碳，氨呈碱性，使得检测液为碱性，此时PH指示剂就显色，颜色变红则提示有幽门螺杆菌感染。(2)组织学检查。将钳取的小块胃黏膜经过染色切片后，显微镜下观察细菌形态，以确定有无幽门螺杆菌感染。这种方法诊断十分可靠。
非侵入性检查是指不经胃镜取组织的途径检查，常用的有：l、13C或14C尿素呼吸试验。呼吸试验原理同样是根据幽门螺杆菌含有丰富的尿素酶的特点。方法：用放射性核素标记尿素中碳，口服经过放射性核素标记过的尿素溶液，尿素如被分解成氨和二氧化碳(通过检测呼出的气体即可测得二氧化碳)，则提示有幽门螺杆菌感染。呼吸试验安全、可靠、快速、无痛苦，更为重要的是临床上常作为治疗后疗效的观察。2、血清学检查。体内有幽门螺杆菌感染，则血清内就会产生幽门螺杆菌抗体，根据这一原理，检测血清内的幽门螺杆菌抗体，如果效价高，则提示幽门螺杆菌生长旺盛。但进行幽门螺杆菌治疗后，幽门螺杆菌抗体效价下降较慢，需半年甚至一年，临床上不可根据幽门螺杆菌抗体数来判断治疗的效果。最好办法是13C或14C尿素呼吸试验。