儿外科开设小儿普通外科，小儿泌尿外科，新生儿外科及小儿微创外科专业。科室以新生儿先天畸形的诊治和腹腔镜微创手术为重点，成功开展食道闭锁，胆道闭锁，胆总管囊肿，巨结肠，肠闭锁，肛门闭锁，肾积水，尿道下裂，脊膜膨出等儿外科具有代表性疾病的诊治。腹腔镜方面成功开展了“单孔腹腔内镜手术(Laparoendoscopic single-site surgery ，LESS)”，经脐单部位腹腔镜手术(Single Site Laparoscopy，SSL)，及经自然腔道腹腔内镜手术(Natural Orifice Transluminal Endoscopic Surgery，NOTES)。手术涉及先天性膈疝修复，肾切除，幽门成形，肠系膜囊肿切除，肠切除吻合，及精索静脉曲张，阑尾炎等。

科室成立“小儿疝微创治疗专科”，重点应用腹腔镜微创治疗小儿腹股沟疝及鞘膜积液等小儿常见病。近年来，科室多项技术获省市级新技术应用奖，并填补本地区空白。