1.各种治疗方法的选择
(1)手术治疗：基本原则是手术切除肿瘤，范围取决于肿瘤侵犯的程度、位置和肿瘤的分级。前尿道癌手术相对简单，术后效果好。
(2)化疗：对转移的肿瘤效果较好，目前主要应用于局部进展性尿道癌手术后或放射治疗后的辅助治疗。
(3)放射治疗：尽管有报道放疗效果好，能保留阴茎，但放疗后可引起皮肤溃疡坏死、尿道狭窄和水肿，同时肿瘤复发率较高，多数学者认为单纯放射治疗的效果不佳，只适用于舟状窝部的早期表浅小肿瘤。一般来说放射治疗应局限于那些早期和不愿接受手术治疗的病人、作为姑息治疗或手术后的辅助治疗。
2.手术治疗的选择
(1)远端尿道癌的治疗：可以行经尿道电切、局部切除、部分切除和根治性切除(必要时可同时去势)。表浅性、乳头状和原位癌，可采用经尿道肿瘤切除或电灼治疗。阴茎龟头尿道开口旁的原位癌(Queyrat红斑)若侵入远端尿道，可采用龟头部分切除、远端尿道切除联合阴茎部尿道重建整形术。若肿瘤已侵犯海绵体，但仍局限于阴茎远侧l/2，可在肿瘤近侧2cm处作阴茎部分切除。浸润性肿瘤位于阴茎的近端尿道或侵犯整段尿道，应行阴茎根治切除术。如果触到腹股沟淋巴结，应行盆腔腹股沟淋巴结清扫术。预防性淋巴清扫无益于尿道癌病人。
(2)球部尿道癌的治疗：早期肿瘤可以经尿道切除或切除肿瘤后尿道端端吻合，但是实际上很少见。多数尿道球膜部肿瘤在确诊时往往已有广泛扩展，应行扩大切除，包括根治性膀胱前列腺切除、全阴茎切除和盆腔淋巴结清扫术，邻近的尿生殖膈和耻骨下支作广泛整块切除可提高治愈率。
(3)前列腺部尿道癌的治疗：少见，可以是尿路上皮癌和腺癌，肛门指检前列腺硬化说明肿瘤已侵犯前列腺，血清PSA和酸性磷酸酶正常。明确诊断取决于经尿道前列腺活检。表浅的前列腺尿道肿瘤可以行经尿道前列腺电切。但大多情况下已侵犯前列腺和膀胱，应该行膀胱前列腺全切除和全尿道切除。浸润性尿道癌的预后差，5年生存率少于20%。有报道应用化疗辅助放射治疗，化疗辅助广泛的经尿道前列腺电切或根治性前列腺切除术能成功治疗尿道癌，提高生存率，但经验尚少。
(4)膀胱切除后残存尿道的处理：由于尿路上皮细胞癌具有多病灶性倾向，即使膀胱全切除，尿道上皮仍然有恶变的潜能。膀胱全切除术后腹壁造口病人尿道癌发生率2.1%~11.1%，原位新膀胱病人0.5%~4%。术后应该定期每3～4个月行尿道冲洗液细胞学检查甚至活检，共随访5年。